Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter (Doktorand*in) (w/m/d) naturwissenschaftlich / bioinformatisch in der translationalen Tumorforschung
Charité – Universitätsmedizin Berlin Stellenangebote →Wissenschaftliche Mitarbeiterin / Wissenschaftlicher Mitarbeiter (Doktorand*in) (w/m/d) naturwissenschaftlich / bioinformatisch in der translationalen Tumorforschung an der Charité – Universitätsmedizin Berlin
Die Arbeit an dem PhD Projekt wird sich darauf konzentrieren mit Hilfe von immunogenomischen Tools minor histocompatibility Antigene (miHAs) in Empfängern von allogener Stammzelltransplantation zu identifizieren und Spender T-Zellen zu finden, die diese miHAs erkennen.
Die Aufgaben umfassen im Speziellen:
- Analyse von Keimbahn whole exome sequencing Daten von Spender und Empfänger zur Identifikation von Minor-Histokompatibilitätsantigenen (miHAs)
- Expansion von T-Zellen aus peripherem Blut nach Transplantation oder aus Stammzelltransplantaten, die miHAs erkennen
- Charakterisierung und longitudinale Analyse miHA-spezifischer T-Zellen mittels Tetramer-Färbungen, Bulk-TCR-Sequenzierung und Einzelzell-TCR-Sequenzierung
- Reexpression und funktionelle Testung miHA-spezifischer T-Zellrezeptoren (TCRs)
- Identifikation geeigneter miHA-spezifischer TCRs für zukünftige klinische Studien
Sie werden als wissenschaftliche/r Mitarbeiter/in beschäftigt: Nach §110 (4), Satz 3 sieht das BerlHG für wissenschaftliche Mitarbeitende eine angemessene Zeit innerhalb der Arbeitszeit für die eigene wissenschaftliche Weiterqualifikation vor.
Wir suchen eine hochmotivierte Doktorandin bzw. einen hochmotivierten Doktoranden mit Interesse an der Kombination von Wet- und Dry-Lab-Methoden der Immunogenomik zur Untersuchung der Dynamik, Phänotypen und Spezifitäten von gegen Leukämiezellen gerichteten T-Zellen.
Ihr Profil
- Einschlägiger fachlicher Hintergrund für das Projekt (abgeschlossenes Studium der Biowissenschaften, Biotechnologie oder Bioinformatik) sowie Erfahrung in zellbasierten Forschungsarbeiten und in der computergestützten Datenanalyse
- Selbstständige Programmierkenntnisse in R, Python, Shell oder vergleichbaren Programmiersprachen in einer UNIX-Umgebung
- Ausgeprägtes Interesse an immunologischen und tumorgenetischen Fragestellungen
- Hohe Motivation, experimentelle und computergestützte Ansätze miteinander zu verbinden
- Kritische und selbstständige Arbeitsweise sowie der Anspruch, bestehende wissenschaftliche Erkenntnisse weiterzuentwickeln