Leibniz-Gemeinschaft

Bioinformatik-Ingenieur/in (w/m/d)

Berlin · Forschungszentrum Borstel, Leibniz Lungenzentrum (FZB), Forschungsgruppe Prof. Amelia E. Barber · Frist: 20.07.2026
Besoldung E 10 TVöD-VKA Arbeitszeit Vollzeit Befristung befristet 2 Jahre Frist 20.07.2026
3.523 – 4.902 €
/Monat brutto · E 10 TVöD-VKA in Berlin
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Aufgaben
• Entwicklung und Pflege bioinformatischer Pipelines für die Analyse prokaryotischer und eukaryotischer Genome und Transkriptome • Installation, Aktualisierung und Fehlerbehebung von Bioinformatik-Tools auf dem HPC-System • Erstellung containerisierter, reproduzierbarer Umgebungen mit Conda und Docker • Benutzersupport für Gruppenmitglieder bei Tool-Installationen, Datenbanken und Workflows • Verwaltung von Forschungsdaten und Organisation der Speicherung auf dem Cluster • Koordination mit dem IT-Team zur Wartung der Recheninfrastruktur
Anforderungen
• Abgeschlossener Bachelor- oder Master-Abschluss in Bioinformatik oder verwandtem Fachgebiet • Erfahrung mit Linux-basierten Rechen- und HPC-Umgebungen • Programmierkenntnisse in Bash, Python, R und Workflow-Sprachen (Snakemake, Nextflow) • Praktische Erfahrung mit NGS-Datenanalyse (WGS, RNAseq, Amplicon-Seq) von Vorteil • Fähigkeit zur selbstständigen, parallelen Projektbearbeitung und Teamfähigkeit • Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten und gute Englischkenntnisse
Redaktionelle Kurzfassung auf Basis der öffentlich zugänglichen Ausschreibung. Der vollständige Text steht bei der ausschreibenden Einrichtung. Zur Original-Ausschreibung →
Besonderheiten
Borstel
Schlagworte
BioinformatikGenomanalyseTranskriptomikNext-Generation-SequencingHPC-SystemeLinuxPythonBashRSnakemakeNextflowDockerCondaDatenmanagementMaster-AbschlussEnglischTeamfähigkeitwissenschaftliche Zusammenarbeit
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