Leibniz-Gemeinschaft
Bioinformatik-Ingenieur/in (w/m/d)
Aufgaben
• Entwicklung und Pflege bioinformatischer Pipelines für die Analyse prokaryotischer und eukaryotischer Genome und Transkriptome
• Installation, Aktualisierung und Fehlerbehebung von Bioinformatik-Tools auf dem HPC-System
• Erstellung containerisierter, reproduzierbarer Umgebungen mit Conda und Docker
• Benutzersupport für Gruppenmitglieder bei Tool-Installationen, Datenbanken und Workflows
• Verwaltung von Forschungsdaten und Organisation der Speicherung auf dem Cluster
• Koordination mit dem IT-Team zur Wartung der Recheninfrastruktur
Anforderungen
• Abgeschlossener Bachelor- oder Master-Abschluss in Bioinformatik oder verwandtem Fachgebiet
• Erfahrung mit Linux-basierten Rechen- und HPC-Umgebungen
• Programmierkenntnisse in Bash, Python, R und Workflow-Sprachen (Snakemake, Nextflow)
• Praktische Erfahrung mit NGS-Datenanalyse (WGS, RNAseq, Amplicon-Seq) von Vorteil
• Fähigkeit zur selbstständigen, parallelen Projektbearbeitung und Teamfähigkeit
• Ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten und gute Englischkenntnisse
Redaktionelle Kurzfassung auf Basis der öffentlich zugänglichen Ausschreibung. Der vollständige Text steht bei der ausschreibenden Einrichtung. Zur Original-Ausschreibung →
Besonderheiten
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